胸心外科

构建肺动脉高压的诊断特征和免疫景观

作者:佚名 来源:MedSci梅斯 日期:2022-12-26
导读

         研究背景: 分子生物标志物被广泛用于疾病诊断和探索发病机制。肺动脉高压(PAH)是一种快速进展的心肺疾病,诊断不及时。从广泛的角度来看,有关与PAH相关的分子生物标志物的研究是有限的。 研究方法: 本研究纳入了两个独立的微阵列队列,包括73个PAH样本和36个正常样本。进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)以确定与PAH相关的关键模块。采用LASSO算法来拟合一个诊断模型。通过生物信息学工具进

关键字:  肺动脉高压 

        研究背景:

        分子生物标志物被广泛用于疾病诊断和探索发病机制。肺动脉高压(PAH)是一种快速进展的心肺疾病,诊断不及时。从广泛的角度来看,有关与PAH相关的分子生物标志物的研究是有限的。

        研究方法:

        本研究纳入了两个独立的微阵列队列,包括73个PAH样本和36个正常样本。进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)以确定与PAH相关的关键模块。采用LASSO算法来拟合一个诊断模型。通过生物信息学工具进一步揭示潜在的生物学机制和免疫景观。

        研究结果:

        WGCNA方法最终确定了两个与PAH明显相关的关键模块。对于这两个模型中的基因,PAH和正常样本之间的差异表达分析进一步确定了九个关键基因。利用这9个基因的表达谱,我们最初在GSE117261中开发了一个由LRRN4、PI15、BICC1、PDE1A、TSHZ2、HMCN1、COL14A1、CCDC80和ABCB1组成的PAH诊断特征(PDS),然后在GSE113439中验证了这个特征。ROC分析显示,两个队列的AUC分别为0.948和0.945。此外,PDS得分高的患者富含大量的Th17细胞和中性粒细胞,而PDS得分低的患者则与肥大细胞和B细胞有很大关系。

        研究结论:

        我们的研究为诊断PAH建立了一个强大的、有前途的特征性PDS,其中的关键基因、新途径和免疫景观为探索PAH的分子机制和潜在的治疗目标提供了新的视角。

        参考文献:

        Duo M, Liu Z, Zhang Y, Li P, Weng S, Xu H, Wang Y, Jiang T, Wu R, Cheng Z.Construction of a diagnostic signature and immune landscape of pulmonary arterial hypertension.Front Cardiovasc Med. 2022 Dec 1;9:940894. doi: 10.3389/fcvm.2022.940894. PMID: 36531729; PMCID: PMC9751874.

        作者:刘少飞

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