The Challenge of HIV-1 Subtype Diversity
Barbara S. Taylor M.D.等
美国纽约哥伦比亚大学医学中心内科和感染病专业
详情请见《中国医学论坛报》
综述
医学进展
HIV-1亚型多样性带来的挑战（图3，表2、3）
图3 在各亚型HIV-1中，蛋白酶多态性引起的主要氨基酸（AA）变化
将HIV-1蛋白酶的AA序列与B亚型的一致序列进行比较。使用斯坦福HIV耐药数据库(http://hivdb.stanford.edu/pages/algs/HIVseq.html)的HIVseq程序，获得多态性数据。如果数据库中某位点310%序列呈多态性，则显示某已知亚型HIV-1蛋白酶AA10~99的多态性。色柱内显示多态性序列的百分率。检索表中显示的是亚型的名称，后面圆括号中标注的是分析中得出的多态性序列数。黑色方块表示主要蛋白酶耐药突变位点，白色方块表示次要蛋白酶耐药突变位点，资料来源为2007年国际艾滋病学会美国分会发布的信息。左侧显示每个位点的主要AA变化。HIV-1逆转录酶AA40~240的多态性见补充附录，该附录与本文全文见www.nejm.org.
表2. 各亚型或流行重组型（CRF）的HIV-1流行特征*
亚型或CRF |
地区 |
全球流行率 |
趋向性和复制 |
疾病进展 |
对治疗的反应 |
亚型 |
A |
东非、中非、中亚及东欧 |
12.3% |
多数利用CCR5，即便是在晚期感染40 |
NA |
与C亚型和D亚型相比无显著差异41 |
B |
美洲、西欧、东亚及大洋洲 |
10.2% |
早期利用CCR5，而感染晚期利用CXCR4增加28 |
HLA-B7与CTL反应差和病毒血症增加相关42，43，HLA-B57与病毒感染进展慢相关42，巴西的B型病毒株与感染进展慢相关44 |
NA |
C |
印度、东非及南非 |
49.9% |
绝大多数利用CCR5，即便是晚期感染28；感染者阴道排毒增加30，母婴传播率升高29，45 |
HLA-B57与病毒感染进展慢相关42 |
与A亚型和D亚型相比无显著差异46，但产生耐药的机制不同41,47-49 |
D |
东非 |
2.5% |
感染早期即使用CXCR427 |
在乌干达、肯尼亚和坦桑尼亚的患者中，疾病进展较A型快37-39 |
NA |
G |
西非 |
6.3% |
NA |
NA |
NA |
F、H、 J和K
|
各不相同 |
每种均低于1.0% |
NA |
NA |
NA |
CRF |
CRF01 _AE |
东南亚 |
4.7% |
初始病毒载量可能较B型感染者高，但感染亚型可能是混杂的50 |
与B亚型相比，疾病进展可能加速36 |
NA |
CRF02 _AG |
西非 |
4.8% |
体外复制率较B亚型高51 |
NA |
NA |
其他 |
各不相同 |
每种均 <0.1% |
NA |
NA |
NA |
* 定位及流行的数据来自Hemelaar等10。其他CRF包括CRF03至CRF34，这一类仍在不断扩充。CTL指细胞毒性T淋巴细胞，NA代表无可用数据。
表3 有关抗逆转录病毒治疗原发性耐药突变的部分研究详情*
研究 |
地区及年份 |
参试者数量 |
亚型或CRF的流行率 |
已知耐药突变的携带率 |
Nkengafac 等69 |
喀麦隆，2005–2006年 |
180 |
B亚型（42%），G亚型 （29%），其他（29%） |
8% |
Palma等70 |
葡萄牙，2003年 |
180 |
B 亚型（42%），G 亚型（29%），其他（29%） |
8% |
Tee等71 |
马来西亚，2003–2004年 |
100 |
CRF01_AE（65%），AE/B（22%），B亚型（12%） |
1% |
Paraskevis 等72 |
希腊，2002–2003年 |
101 |
B亚型（48%）, A亚型（33%） |
9% |
Ly等73 |
柬埔寨，2003–2004年 |
144 |
CRF01_AE （97%） |
5% |
Descamps 等74 |
法国，2001–2002年 |
662 |
B 亚型（71%），非B亚型 （29%） |
发生在B亚型12%急性感染者和2%慢性感染者中，非B亚型感染者中较少 |
Wensing 等75 |
欧洲，1996–2002年 |
2208 |
B亚型 （70%），C亚型 （10%） |
在B亚型感染者中为13%，在非B
亚型感染者中为5% |
Vazquez de Parga 等76 |
前苏联，1997–2004年 |
278 |
A 亚型（80%） |
逆转录酶突变患者中的耐药率为13%，蛋白酶突变患者中的耐药率为 4% |
Roudinskii 等77 |
前苏联，1995–2003年 |
119 |
A亚型 （97%） |
未检测到 |
Grossman 等49 |
以色列，1999–2003年 |
117 |
C 亚型（75%），B亚型 （25%） |
C亚型感染者中的耐药率为50%，B亚型感染者中的耐药率为10% |
Deshpande 等78 |
印度，2003年 |
128 |
C亚型 （96%） |
<2% |
Maljkovic 等79 |
瑞典，1998–2001年 |
100 |
B 亚型（55%），C亚型 （29%） |
9% |
*这些研究是在2007年5月一次复习文献时选择的纳入至少100个分离株的研究。次要蛋白酶突变没有被计算在已知耐药突变的携带率中。CRF是指流行重组型。 |
